Les vallées des cours d’eau et leurs milieux associés (étangs, prairies humides, …) offrent une diversité biologique importante.

Les vallées encaissées de la Moine, de la Sèvre sont classées en ZNIEFF (Zones Naturelles d’Intérêt Ecologique Faunistique, floristique).

Préserver ces zones c’est aussi maintenir leur fonction d’auto-épuration et de régulation des eaux.

Le SAGE propose 7 axes de travail pour retrouver une bonne qualité des milieux aquatiques :

- Connaître et préserver les zones humides
- Préserver les prairies de fond de vallée
- Connaître le bocage, le préserver et le développer
- Protéger et reconquérir l’axe migratoire pour l’anguille
- Restaurer et entretenir les cours d’eau principaux
- Gérer les ruisseaux
- Analyser, en concertation, l’impact et l’intérêt des ouvrages hydrauliques, définir, mettre en œuvre des plans de gestion des ouvrages

Les communes sont invitées à réaliser un diagnostic communal environnemental lors de l’élaboration, la modification, la révision des documents d’urbanisme (PLU,…) recensant le maillage bocager, les zones humides de leur territoire et proposant, en concertation, les moyens de préservation et de gestion de ce patrimoine naturel.

Un certain nombre de ces actions sont déjà portées par les 7 syndicats de rivière du bassin versant dans le cadre du Contrat Restauration-Entretien de la Sèvre et de ses affluents.