Les milieux aquatiques du bassin de la Sèvre nantaise sont caractérisés par une grande variété : cours d’eau, zones humides...

Ces milieux sont souvent façonnés de la main de l’homme. Les ouvrages hydrauliques conditionnent ainsi fortement leur fonctionnement sur le bassin de la Sèvre nantaise.
On recense sur ce territoire près de 380 km de cours d’eau principaux (Sèvre nantaise, Moine, Maine, Sanguèze) auxquelles s’ajoutent plus de 1900 km de petits cours d’eau. Ces derniers peuvent être permanents ou temporaires.

De manière générale, une rivière n'est pas seulement le lieu où s'écoule une eau plus ou moins abondante, ou plus ou moins chargée en pollution, ou le support d'une ressource halieutique. C'est un ensemble complexe en interaction avec sa vallée et son bassin versant; c'est aussi un objet social.

Un cours d’eau en bonne santé sur le bassin de la Sèvre Nantaise peut se caractériser par :

- Des écoulements variés, des débits suffisants en période d’étiage
- Une ripisylve équilibrée (lien partie ripisylve)
- La présence de zones d’expansion de crues, de zones humides
- Une dynamique sédimentaire
- Une eau de bonne qualité